Serangan oleh tentera Turki Seljuk ke atas Vaspurakan bermula pada 1050-an .Pada 1071 mereka menang di pertempuran Manzikert dan seluruh rantau jatuh.Pemerintah Islam tempatan muncul, seperti Ahlatshahs dan Ayyub (1207). Selama 20 tahun, Van di bawah kuasa Kesultanan Seljuk Anatolia sehingga 1240s apabila ia telah ditawan oleh orang Mongol . Abad ke-14, Van diperintah oleh Kara Koyunlu Turki, dan kemudiannya oleh yang Timurids .